Os órgãos sociais da AFP representam o farmacêutico comunitário junto da tutela e dos parceiros do setor da saúde, assegurando o respeito pelos seus direitos e a valorização da sua intervenção pela saúde pública no âmbito da estratégia implementada pelo Serviço Nacional de Saúde.

Os membros da direção da AFP mantêm uma relação de proximidade e de contacto assíduo com os seus associados. Visitam as farmácias e valorizam as sugestões e opiniões dos farmacêuticos na tomada de decisões dos órgão Sociais, bem como no lançamento de novos serviços e formações.