O ECDC publicou o seu mais recente plano de trabalho para 2019-2021, tendo como prioridades a resistência antimicrobiana, a cobertura vacinal, os Objetivos de Desenvolvimento Sustentável das Nações Unidas na área do HIV, tuberculose e hepatite, a preparação para ameaças à saúde transfronteiriça, as parcerias sinérgicas e a monitorização do seu próprio desempenho.