A AFP foi constituída com um pequeno grupo de 6 farmácias. Na base da constituição da AFP esteve a intenção de se formar uma Associação que se baseasse num espírito comunitário e de serviço quer às farmácias, quer à comunidade. É este o espírito que ainda hoje prevalece na Associação de Farmácias de Portugal
1992
Sob a presidência da Sr.ª Dr.ª Graça Pereira Lopes, são celebrados os protocolos com a ADSE, Ministério da Justiça e PSP
1992-97
É estabelecido um conjunto alargado de protocolos com entidades públicas e privadas
1998
Já com 25 associadas, a Sr.ª Dr.ª Margarida Coutinho assume a presidência da Direção e, no ano seguinte, a AFP participa pela primeira vez na Comissão Nacional de Publicidade do Medicamento (CNPM) e aumenta o seu conjunto de protocolos
2004
O Sr. Dr. Alfredo Brito torna-se o terceiro presidente e a AFP já representa 50 associadas O desenvolvimento dos seguros de saúde em Portugal levam a AFP a assegurar protocolos com as empresas emissoras
2005
A Sr.ª Dr.ª Graça Pereira Lopes assume a presidência
2006
As farmácias aderem ao pagamento direto do Estado e a AFP passa a representar 75 associadas
2008
A AFP passa a representar 100 associados. É assinado o protocolo de colaboração com a Universidade Lusófona e é lançado o Portal das farmácias - www.portaldasfarmacias.com.
2009
É lançada a revista 'Infopharma' com distribuição nacional
2010
A Sr.ª Dr.ª Maria Helena Castro Machado torna-se a quarta presidente eleita
2014
A Sr.ª Dr.ª Manuela Pacheco é a quinta presidente eleita da AFP, cargo que desempenhará até 2018
2016
É criada a plataforma AFPConnect - um serviço integrado de troca de informação automático entre as Farmácias, os Subsistemas de Saúde e/ou Entidades Públicas
2017
A AFP apresenta um site totalmente renovado e adaptado às novas realidades – www.afp.com.pt
2018
Já com mais de 150 farmácias, a Sr.ª Dr.ª Manuela Pacheco é reeleita, como presidente da AFP, para mais 4 anos de cargo
2022
A Sr.ª Dr.ª Isabel Cortez é eleita presidente da AFP, cargo que desempenhará até 2026